Supercomputador ATUQ
El supercomputador ATUQ posee en la actualidad 1116 cores distribuidos en 39 nodos de cómputo en 8 chasis y 3 servidores rackeables conectados mediante redes infiniband de 52 Gbps y 100 Gbps.
- 988 cores en slurm actualmente+atuq-7-1+atuq-4-10+atuq-2-8+atuq+nfs
- Fuera de producción: 104 cores
- atuq-7-1: 48 cores
- atuq-7-2: 48 cores
- atuq-7-3: 64 cores
- atuq-4-10: 24 cores
- atuq-2-8: 32 cores
- Distribucion del almacenamiento:
- 7.7 TB users
- 3 TB scratch
- 10 TB users nfs
- 3 TB scratch nfs
- 11 TB apps nfs
- 10 TB respaldos nfs
- 7.4 TB share nfs
- Nodo atuq-6-8 aumenta su número de cores de 24 a 48 cores
Actualmente el supercomputador cuenta con decenas de usuarios activos de universidades, instituciones públicas y privadas, los mismos que utilizan el sistema de encolamiento a fin de utilizar los recursos de procesamiento: núcleos de los procesadores y memorias para la ejecución de sus trabajos programados.
Las instituciones que usan el servicio del HPC-Modemat son:
- Investigadores de la Escuela Politécnica Nacional,
- Escuela Superior Politécnica del Litoral ESPOL,
- Instituto Nacional de Meteorología e Hidrología INAMHI,
- Laboratorio Mixto Internacional GREATICE,
- Pontificia Universidad Católica del Ecuador,
- Universidad San Francisco de Quito,
- Universidad Técnica de Ambato,
- Facultad Latinoamericana de Ciencias Sociales FLACSO,
- Fundación Charles Darwin,
- Universidad Técnica de Manabí,
- Instituto Nacional de Estadísticas y Censo INEC
El centro de datos del Modemat
El centro de datos del Modemat es una instalación física que alberga al Supercomputador ATUQ, gran cantidad de equipos de cómputo y servidores, así como sistemas de almacenamiento y equipos de red, todos ellos utilizados para el procesamiento de datos de investigaciones.
El centro de datos especializado fue diseñado para garantizar el alto rendimiento, disponibilidad y seguridad de datos y servicios que alojan el Laboratorio Nacional de Cálculo Científico se caracteriza:
- Sistema de aire acondicionado de precisión y control de humedad.
- Piso falso con ventilación.
- Sensores de humedad, sistema contra incendios.
- UPS 40KVA (hasta 100 KVA).
- Cámaras de seguridad.
- Acceso biométrico.
Sistema Operativo
S.O. Linux para HPC (master-workers) con kernel optimizado para computación distribuida y/o en paralelo y ambiente de ejecución prearrange (PXE).
Sistema de archivos
NFS
OpenFabrics InfiniBand
Open MPI y librerías MVAPICH
Gestor de trabajos
SLURM (60% del Top500)
Herramientas de administración escalables
SLURM, LDAP
Herramientas de monitoreo
AKCP, GRAFANA, XDMOD
Aplicaciones de Cálculo Científico
- Matlab (Licencia hasta 200 cores)
Desarrollo
- Compiladores de C, C++ y Fortran
- Intel Parallel Studio
- Python 2, 3 (lenguaje interpretado) con módulos para procesamiento gráfico y machine learning (TensorFlow)
- Julia (resolución numérica en general)
- CUDA (librerías de cómputo en GPU)
- R (Software de estadística y procesamiento de información)
- FENICS software de resolución de modelización variacional. Ej. Dinámica de fluidos
- Singularity
Meteorología
- WRF/WRFDA (Weather Research and Forecasting Model)
- COSMO (Consortium for Small Scale Modeling)
Biomatemática
- RAxML (software de reconstrucción árboles filogenéticos)
Contenerización
- Docker